准备：入孵前天检查孵化机动转是否正常。
码盘：将贮蛋室的蛋取出后，放置在室内常温下，使种蛋逐步提高蛋温，然后把蛋排放在孵化盘上，这叫“码盘”。排放时，因鸵鸟蛋的大端与小端不清楚，必须在排蛋时进行照蛋，将蛋的大端，即有气室端朝上放。
消毒：码盘后，将孵化盘移入孵化机，并与孵化机一同熏蒸消毒，消毒后，排出污气，然后进行开机孵化。
照蛋和落盘：孵化过程照蛋次，第一次照蛋，是在孵化第6天进行，这时可明显检出无精蛋和死精蛋。孵化蛋第16天再照蛋一次，检出死胚蛋，将照过正常发育的蛋排列，横放到出雏盘内。将排好蛋的出雏盘，放进出雏机内孵化，这叫“落盘”。
出雏：胚蛋放入出雏机孵化至6天，健壮的雏鸵鸟便开始破壳，第3天大量出壳，第6天出壳完毕。小鸵鸟破壳时，先在蛋壳上啄一个大洞，休息一下后，再用强而有力的腿，将壳踢开，但弱雏需人工助产，才能破壳。助产时不得强行剥离蛋壳，以免造成损失。雏鸵鸟的处理：雏鸵鸟出壳后，让其在出雏机内休息5小时后，转入育雏室饲养。
